在液相色譜分析系統中，對色譜柱溫度控制的要求越來越高，藥典及諸多新的分析方法，也對柱溫給出條件限制。色譜柱恒溫箱可以、穩定地控制色譜柱的工作溫度，對于有效地提高柱效，改善色譜峰的分離度、峰形對稱性，縮短保留時間，降低柱反壓，減少泵的磨損，保證分析樣品結果的準確性和重復性，具有不可忽視的作用。
柱溫箱的常見故障分析：
1.開機面板不亮：檢查插座電源及保險絲；
2.PV有數值有聲音：過溫報警，改變報警溫度或設定溫度；
3.PV無數值有聲音：為接線松動，鉑電阻接線開路或短路，返廠維修；
4.溫度波動大：改動了內部參數，還原原記錄值即可；
5.不制冷或不加熱、導熱液微循環泵工作聲音異常，請先考慮是否在儀器正常的延時保護時間內，其次檢查儲液罐內潛水泵是否正常工作（潛水泵單獨工作時能產生 0.5L/min液體流量），包括上述的固體顆粒雜質堵塞潛水泵進水口海綿質過濾篩網的故障排除，再次檢查主輸液泵是否能正常工作（主輸液泵單獨工作時能 產生1.2L/min液體流量），通常由于導熱液中所含氣泡進入泵頭導致泵空運轉，無法輸送導熱液所致，可將色譜柱恒溫箱切換至加熱模式下多運行一段時間，潛水泵會自動將流路內氣體排出至導熱液儲液罐內上部貯存。如經過流量計流量無明顯改進，可將柱箱側立起來（面板式流量計側朝下，請注意保護面板式流量 計不受損壞）通電開機數分鐘直至故障解除，若無效換一側重復上述操作。
